农业水价综合改革主要通过水权分配划分用水责任，明确农民灌溉用水的权利和节约用水的责任，用价格杠杆刺激农民履行节约用水，节水有奖，浪费受罚，促进粗放式的灌溉方式向绿色的节水灌溉生产方式转变。
同时又要考虑农民的承受能力，在激励节水灌溉的同时，通过定额内精准补贴和节水奖励的措施，保障粮食等重要农作物合理用水需求，总体上不增加农民负担。
同时，农业用水有补贴，节约用水有奖励。
（一）农业用水精准补贴。精准补贴范围主要为从事小麦、玉米等粮食作物种植的定额内实际用水量。对农业水价调整到位、农业用水量未超灌溉定额、水费足额缴纳的用水主体给予补贴。
（二）农业用水节水奖励。节水奖励指对积极推广节水技术、调整优化种植业结构、取得节水成效的用水主体给予奖励。奖励额度主要依据节水量、节水措施和节水成效等因素综合确定。节水奖励采取“节约部分奖励，超定额部分实行阶梯加价”模式。对采取节水措施、节水成效显著的用水主体，实际农业灌溉用水量低于农业用水定额部分进行奖励。对超出农业用水定额部分按价格部门核定的价格累进加价收缴水费。
